VISI:
MTsN 9 Bantul memiliki visi: Terwujudnya Peserta Didik yang Berintegritas, Religius, Unggul, Berwawasan Global, dan Ramah Lingkungan (Berlian)
MISI:
1. Menumbuhkembangkan integritas tinggi dalam sikap dan perilaku peserta didik
2. Menumbuhkembangkan semangat penghayatan dan pengalaman ajaran Islam 17 dan bersikap moderat dalam kehidupan sehari-hari
3. Mewujudkan generasi yang unggul dan berprestasi dalam segala bidang
4. Menciptakan generasi yang berwawasan global
5. Mewujudkan warga madrasah yang ramah dan memiliki kepedulian terhadap lingkungan